Os educadores e professores interessados em implementar o Programa devem registar-se na Plataforma Moodle da Fundação Aga Khan Portugal. Após validação do registo, inscrevem-se na disciplina Conto Contigo para terem acesso ao Curso de Formação, todo em formato e-learning.
As escolas devem identificar os alunos que poderão beneficiar da participação no Conto Contigo e contactar as famílias para dar a conhecer o Programa e agendar as sessões - a presença das famílias em todas as sessões é indispensável ao sucesso do mesmo.
As sessões podem decorrer na biblioteca da escola, na sala de aula ou noutro espaço considerado adequado à estrutura das atividades.